“第七位的菜鸟魔术师被卷入名为“圣杯战争”的厮杀战场，在骚乱的最后召唤出了级别在“第一位”的Servant Saber，并成为Master奔波于夜色之中……”这个耳熟能详的故事开始。虽然《Fate/Prototype》是《Fate/stay night》的原型作品，但在设定上还是有不少的不同，当中最大的分别莫过于Saber组合的这对主从了。在《Fate/Stay Night》中作为主角的卫宫士郎在Prototype中并未出场，Prototype中主角是一名叫沙条绫香的女生，而Saber则是男性的亚瑟王。好胜、聪慧却多少给人以有些厌世的出家人之感的绫香，以及立于少女背后一边嘴里损个不停一边微笑着守护她的Saber，两人的组合就是这样一种关系，参照Fate/Stay Night中远坂凛和Archer（英灵卫宫）的组合就可以很好的理解。